Em uma noite escura, em Nova York, Ryu é perseguido e atacado por assassinos. Depois de eliminá-los, ele encontra um cartão da Friedman Company. No dia seguinte, foi anunciado que o Dr. Ned Friedman descobriu a cura para o câncer. Mas, depois de fornecer nenhuma informação em sua conferência de imprensa, uma repórter chamada Sarah decide investigar com a ajuda de seus amigos Robert e Jeff. Ao passar pela casa um dia do Dr. Friedman, Ryu ouve a voz de uma moça pedindo ajuda. Quando Sarah e seus amigos investigam a casa, bem como, se deparam com seu colega, Ryu. Após isso, eles descobrem que Dr. Friedman fez experiências com seres humanos vivos que os utilizam em uma biotecnologia, e que pode ter algo a ver com o poder dos deuses do mal, a quem Ryu havia derrotado no passado. Mas quando a amada de Ryu, Irene, é sequestrada, ele deve comprir seu papel como o Ninja Dragão mais uma vez para derrotar este novo inimigo e salvá-la.
